課程資訊
課程名稱
環境微生物機能工學特論
Special Topics in Environment Microbial Engineering 
開課學期
108-1 
授課對象
生物資源暨農學院  生物科技研究所  
授課教師
劉啟德 
課號
Biot7005 
課程識別碼
642EM0060 
班次
 
學分
3.0 
全/半年
半年 
必/選修
選修 
上課時間
星期三6,7,8(13:20~16:20) 
上課地點
 
備註
本課程以英語授課。上課地點:生物科技所R415。
限碩士班以上
總人數上限:10人 
Ceiba 課程網頁
http://ceiba.ntu.edu.tw/1081Biot7005_ 
課程簡介影片
 
核心能力關聯
核心能力與課程規劃關聯圖
課程大綱
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課程概述

Microbial populations are a key component of terrestrial and aquatic ecosystems and are responsible for mediating a number of important functions, including nutrient cycling and biogeochemical transformations. Molecular biology tools now allow us to describe the diversity and structure of microbial communities in natural systems, and relate these to environmental drivers and ecosystem function.
Course Outline
1.Nucleic acid recovery from environmental samples
2.Prokaryotic systematics:
3.DNA fingerprinting of microbial communities
4.Molecular typing of environmental isolates
5.Expression analysis of functional genes
6.Quantification of environmental microbes
7.Microbial ecology and genomics
8.Molecular detection of uncultured microorganisms
9.Bioremediation
10.Bioinformatics and web resources for phylogenetic analyses 

課程目標
The goal of this course is to let students acquire knowledge of the diverse roles that microorganisms play in biological transformations in our environment. 
課程要求
Fundamental knowledge of molecular biology and biochemistry 
預期每週課後學習時數
 
Office Hours
 
指定閱讀
待補 
參考書目
Scientific journals 
評量方式
(僅供參考)
   
課程進度
週次
日期
單元主題
第1週
9/11  Introduction 
第2週
9/18  190918 Microbial diversity 
第3週
9/25  One slide presentation for Microbial diversity 
第4週
10/02  Petroleum Biodegradation and Bioremediation 191002 
第5週
10/09  Paper: NATURE COMMUNICATIONS | (2019)10:1816  
第6週
10/16  Metabolic potential of uncultured bacteria and archaea associated with petroleum seepage in deep-sea sediments191016  
第7週
10/23  Handy tools for research 
第8週
10/30  Beauty and Sadness of Plastics  
第9週
11/06  Microbial degradation of polymer 
第15週
12/18  Rhamnolipids from Pseudomonas aeruginosa disperse the biofilms of sulfate-reducing bacteria  
第16週
12/25  Electricity-producing Bacteria